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血清淀粉酶除來源于胰腺外，還來源于唾液腺及許多其他組織，所以在淀粉酶活性升高時，同工酶的測定有助于的鑒別診斷。P-同工酶升高或降低時，說明可能有胰腺;S-同工酶的變化可能是源于唾液腺或其他組織。當血清淀粉酶活性升高而又診斷不清時，應進一步測定同工酶以助鑒別診斷。有許多方法可以測定同工酶，瓊酯糖和醋纖膜電泳法都是比較常用的方法。

淀粉酶的測定結果受方法的影響較大，不同方法參考值亦有所不同，所用方法也較多，因此必須了解所用測定方法和其參考值，才能作出正確的診斷。